La labor de la Dirección consiste en velar por la formación de cada uno de los colegiales para que sepan desempeñar el papel que les corresponde, y por el buen desarrollo de toda esta tarea formativa. Son responsables de que este proceso sea una realidad viva y no una oferta de actividades desorientadas y sin relación en cada una de las sedes de Belagua. Asumen la responsabilidad educativa de los colegiales asignados a su respectiva sede. En cada sede el consejo de dirección lo forman, al menos, un director, un subdirector y un secretario. Cada uno de ellos tiene funciones distintas en la dirección.